Zona Baja: Se extiende por la planicie costanera con una vegetación selvática inaccesible a través
de árboles preciados por su madera de caoba, guayacán, roble y balsa. Matapalos abrazando otros árboles
son fáciles de encontrar así como varias especies de las más espectaculares orquídeas, bromelias y helechos
Zona Alta: La vegetación deja su carácter tropical para dar paso a las lagunas y a las especies vegetales andinas típicas como el pumamaqui,
el quishuar y el romerillo, y al páramo. Incluso la chuquiragua -la flor del andinista- se puede encontrar en las partes
altas del Cotacachi, el volcán más alto de la Reserva (4.939 m.s.n.m).
Naturaleza - FAUNA
Zona Baja: La existencia de abundante vegetación selvática permite el hábitat necesario para
animales como: los tapires, tigrillos, osos hormigueros, nutrias, boas y jaguares, protegidos aún
en la dificultad del acceso al lugar
Zona Alta: La fauna es por ende típica de estas zonas más frías: es común observar: lobos de páramo, venados, conejos
y, entre las aves, curiquingues y guarros; más difícil es encontrarse con los pumas, armadillos y
cóndores que, por supuesto, también habitan este ecosistema.